MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid At

Total Repeats: 10610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_003064	TGG	2	6	188514	188519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186530
3502	NC_003064	CGGCG	2	10	188580	188589	0 %	0 %	60 %	40 %	159186530
3503	NC_003064	CGA	2	6	188677	188682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186530
3504	NC_003064	GTGG	2	8	188726	188733	0 %	25 %	75 %	0 %	159186530
3505	NC_003064	CCG	2	6	188796	188801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186530
3506	NC_003064	CAAG	2	8	188808	188815	50 %	0 %	25 %	25 %	159186530
3507	NC_003064	ATGC	2	8	188951	188958	25 %	25 %	25 %	25 %	159186530
3508	NC_003064	TCA	3	9	188961	188969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186530
3509	NC_003064	ACG	2	6	188970	188975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186530
3510	NC_003064	CAC	2	6	189016	189021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159186530
3511	NC_003064	GCG	2	6	189077	189082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186530
3512	NC_003064	GA	3	6	189087	189092	50 %	0 %	50 %	0 %	159186530
3513	NC_003064	TTGG	2	8	189098	189105	0 %	50 %	50 %	0 %	159186530
3514	NC_003064	TGC	2	6	189136	189141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186530
3515	NC_003064	CAGC	2	8	189178	189185	25 %	0 %	25 %	50 %	159186530
3516	NC_003064	GCT	2	6	189268	189273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186530
3517	NC_003064	CAG	2	6	189299	189304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186530
3518	NC_003064	CGC	2	6	189328	189333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186530
3519	NC_003064	ACA	2	6	189443	189448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186530
3520	NC_003064	GCG	2	6	189468	189473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186530
3521	NC_003064	GCGA	2	8	189489	189496	25 %	0 %	50 %	25 %	159186530
3522	NC_003064	TGC	2	6	189723	189728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186530
3523	NC_003064	GAC	2	6	189809	189814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186530
3524	NC_003064	GCT	2	6	189882	189887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186530
3525	NC_003064	CGC	2	6	189901	189906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186530
3526	NC_003064	TGG	2	6	189909	189914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186530
3527	NC_003064	ACCT	2	8	190028	190035	25 %	25 %	0 %	50 %	159186530
3528	NC_003064	GC	3	6	190085	190090	0 %	0 %	50 %	50 %	159186530
3529	NC_003064	TGG	2	6	190131	190136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186530
3530	NC_003064	TGG	3	9	190182	190190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186530
3531	NC_003064	GTGC	2	8	190196	190203	0 %	25 %	50 %	25 %	159186530
3532	NC_003064	TCT	2	6	190225	190230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186530
3533	NC_003064	TCA	2	6	190254	190259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186530
3534	NC_003064	GCG	2	6	190336	190341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_003064	GC	3	6	190370	190375	0 %	0 %	50 %	50 %	16119417
3536	NC_003064	ACC	2	6	190401	190406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119417
3537	NC_003064	GCC	2	6	190426	190431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119417
3538	NC_003064	CTG	2	6	190481	190486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119417
3539	NC_003064	TCTCGC	2	12	190515	190526	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16119417
3540	NC_003064	CTT	2	6	190583	190588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119417
3541	NC_003064	TGC	2	6	190687	190692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119417
3542	NC_003064	TGAA	2	8	190776	190783	50 %	25 %	25 %	0 %	16119417
3543	NC_003064	AGC	2	6	190785	190790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119417
3544	NC_003064	GC	3	6	190789	190794	0 %	0 %	50 %	50 %	16119417
3545	NC_003064	GGCTC	2	10	190801	190810	0 %	20 %	40 %	40 %	16119417
3546	NC_003064	TCGAT	2	10	190864	190873	20 %	40 %	20 %	20 %	16119417
3547	NC_003064	CGA	2	6	190891	190896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119417
3548	NC_003064	GCG	2	6	190974	190979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119417
3549	NC_003064	AGG	2	6	190982	190987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119417
3550	NC_003064	GCA	2	6	190994	190999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119417
3551	NC_003064	GCT	2	6	191002	191007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119417
3552	NC_003064	AAC	2	6	191033	191038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119417
3553	NC_003064	CAG	2	6	191039	191044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119417
3554	NC_003064	CTG	2	6	191051	191056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119417
3555	NC_003064	GGT	2	6	191095	191100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_003064	TGAT	2	8	191123	191130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_003064	CAT	2	6	191194	191199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_003064	CTG	2	6	191317	191322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119418
3559	NC_003064	CGG	2	6	191350	191355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119418
3560	NC_003064	TCG	2	6	191412	191417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119418
3561	NC_003064	AGCC	2	8	191459	191466	25 %	0 %	25 %	50 %	16119418
3562	NC_003064	CGA	2	6	191639	191644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119418
3563	NC_003064	CGC	2	6	191724	191729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119418
3564	NC_003064	GCTC	2	8	191843	191850	0 %	25 %	25 %	50 %	16119418
3565	NC_003064	GC	4	8	191883	191890	0 %	0 %	50 %	50 %	16119418
3566	NC_003064	GCA	2	6	191946	191951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119418
3567	NC_003064	ACGGGG	2	12	191957	191968	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	16119418
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3569	NC_003064	TTG	2	6	192003	192008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119418
3570	NC_003064	GCG	2	6	192013	192018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119418
3571	NC_003064	GTC	2	6	192102	192107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119418
3572	NC_003064	TC	3	6	192157	192162	0 %	50 %	0 %	50 %	16119418
3573	NC_003064	AGC	2	6	192166	192171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119418
3574	NC_003064	ATG	2	6	192301	192306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186531
3575	NC_003064	CGT	2	6	192331	192336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186531
3576	NC_003064	CGG	2	6	192375	192380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186531
3577	NC_003064	AAGA	2	8	192395	192402	75 %	0 %	25 %	0 %	159186531
3578	NC_003064	TGT	2	6	192582	192587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186531
3579	NC_003064	TGG	2	6	192617	192622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186531
3580	NC_003064	CGG	2	6	192627	192632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186531
3581	NC_003064	CGGG	2	8	192660	192667	0 %	0 %	75 %	25 %	159186531
3582	NC_003064	GGGAA	2	10	192680	192689	40 %	0 %	60 %	0 %	159186531
3583	NC_003064	AT	3	6	192693	192698	50 %	50 %	0 %	0 %	159186531
3584	NC_003064	GCC	2	6	192729	192734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186531
3585	NC_003064	GAT	2	6	192741	192746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186531
3586	NC_003064	GGAT	2	8	192791	192798	25 %	25 %	50 %	0 %	159186531
3587	NC_003064	CGTTC	2	10	192966	192975	0 %	40 %	20 %	40 %	159186531
3588	NC_003064	TCG	2	6	192986	192991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186531
3589	NC_003064	GGC	2	6	193052	193057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_003064	TAA	2	6	193079	193084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119420
3591	NC_003064	AG	3	6	193120	193125	50 %	0 %	50 %	0 %	16119420
3592	NC_003064	CA	3	6	193127	193132	50 %	0 %	0 %	50 %	16119420
3593	NC_003064	CGA	2	6	193193	193198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119420
3594	NC_003064	ACG	2	6	193283	193288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119420
3595	NC_003064	CGA	2	6	193315	193320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119420
3596	NC_003064	GCC	2	6	193364	193369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119420
3597	NC_003064	CCT	2	6	193372	193377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119420
3598	NC_003064	TTC	2	6	193382	193387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119420
3599	NC_003064	GGC	2	6	193479	193484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119420
3600	NC_003064	GAT	2	6	193494	193499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119420
3601	NC_003064	CGTGGG	2	12	193558	193569	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	16119420
3602	NC_003064	CGC	2	6	193593	193598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119420
3603	NC_003064	TCA	2	6	193622	193627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119420
3604	NC_003064	GCT	2	6	193630	193635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119420
3605	NC_003064	AGC	2	6	193679	193684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119420
3606	NC_003064	AGG	2	6	193688	193693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119420
3607	NC_003064	CGAA	2	8	193871	193878	50 %	0 %	25 %	25 %	16119420
3608	NC_003064	GGAT	2	8	194036	194043	25 %	25 %	50 %	0 %	16119420
3609	NC_003064	CAAC	2	8	194116	194123	50 %	0 %	0 %	50 %	159186532
3610	NC_003064	GAC	2	6	194142	194147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186532
3611	NC_003064	GAT	2	6	194239	194244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186532
3612	NC_003064	GAC	2	6	194254	194259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186532
3613	NC_003064	CAG	2	6	194269	194274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186532
3614	NC_003064	CGAT	2	8	194360	194367	25 %	25 %	25 %	25 %	159186532
3615	NC_003064	GCC	2	6	194440	194445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186532
3616	NC_003064	AGC	2	6	194489	194494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186532
3617	NC_003064	GTA	2	6	194533	194538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186532
3618	NC_003064	GT	3	6	194658	194663	0 %	50 %	50 %	0 %	159186532
3619	NC_003064	GCCG	2	8	194745	194752	0 %	0 %	50 %	50 %	159186532
3620	NC_003064	CGC	2	6	194793	194798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186532
3621	NC_003064	TGG	2	6	194835	194840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186532
3622	NC_003064	TTC	2	6	194873	194878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186532
3623	NC_003064	TTC	2	6	194896	194901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186532
3624	NC_003064	TCC	2	6	194984	194989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159186532
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3630	NC_003064	TTG	2	6	195153	195158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3632	NC_003064	CGGC	2	8	195185	195192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3633	NC_003064	TGC	2	6	195242	195247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186533
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3639	NC_003064	GAT	2	6	195639	195644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186533
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3654	NC_003064	GCG	2	6	196465	196470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3655	NC_003064	GACC	2	8	196585	196592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3656	NC_003064	CGG	2	6	196635	196640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3657	NC_003064	CCA	2	6	196645	196650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3660	NC_003064	CTG	2	6	196714	196719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186534
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3663	NC_003064	GCC	2	6	196867	196872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186534
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3683	NC_003064	GCCAAG	2	12	197611	197622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186534
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3689	NC_003064	CTG	2	6	197821	197826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186534
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3699	NC_003064	GCA	2	6	198321	198326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3716	NC_003064	CGGAT	2	10	199354	199363	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3722	NC_003064	GCGCC	2	10	199521	199530	0 %	0 %	40 %	60 %	159186535
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3728	NC_003064	CTC	2	6	199938	199943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159186535
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3732	NC_003064	GGTC	2	8	200420	200427	0 %	25 %	50 %	25 %	159186535
3733	NC_003064	GCT	2	6	200459	200464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186535
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3737	NC_003064	GGA	2	6	200599	200604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3743	NC_003064	GCG	2	6	200812	200817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119427
3744	NC_003064	TCG	2	6	200833	200838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119427
3745	NC_003064	CGT	2	6	200852	200857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119427
3746	NC_003064	CCG	2	6	200871	200876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119427
3747	NC_003064	GCC	2	6	200973	200978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119427
3748	NC_003064	TCG	2	6	201004	201009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119427
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3750	NC_003064	ACC	2	6	201088	201093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119427
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3752	NC_003064	TCG	2	6	201310	201315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119427
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3759	NC_003064	GCC	2	6	201752	201757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3760	NC_003064	CG	3	6	201778	201783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3761	NC_003064	GAC	2	6	201813	201818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186536
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3767	NC_003064	ATC	2	6	202243	202248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186536
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3774	NC_003064	CGA	2	6	202472	202477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186536
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3779	NC_003064	T	6	6	202902	202907	0 %	100 %	0 %	0 %	159186536
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3782	NC_003064	CGT	2	6	203013	203018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186536
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3800	NC_003064	CGC	2	6	204112	204117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3802	NC_003064	GCT	2	6	204165	204170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3803	NC_003064	AGGCTC	2	12	204218	204229	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3819	NC_003064	GCT	2	6	204973	204978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186538
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3824	NC_003064	TAC	2	6	205127	205132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186538
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3854	NC_003064	CGGC	2	8	206833	206840	0 %	0 %	50 %	50 %	16119432
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3862	NC_003064	GC	3	6	207227	207232	0 %	0 %	50 %	50 %	16119432
3863	NC_003064	CGA	2	6	207256	207261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119432
3864	NC_003064	TCG	2	6	207354	207359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3865	NC_003064	G	6	6	207366	207371	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3866	NC_003064	TGG	2	6	207407	207412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3869	NC_003064	TGA	2	6	207571	207576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119433
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3976	NC_003064	ATCG	2	8	212533	212540	25 %	25 %	25 %	25 %	16119440
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3984	NC_003064	CGC	2	6	212932	212937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119440
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3987	NC_003064	GC	3	6	213100	213105	0 %	0 %	50 %	50 %	16119440
3988	NC_003064	AGC	2	6	213150	213155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119440
3989	NC_003064	GACC	2	8	213200	213207	25 %	0 %	25 %	50 %	16119440
3990	NC_003064	GTG	2	6	213210	213215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119440
3991	NC_003064	CCA	2	6	213220	213225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119440
3992	NC_003064	CCG	2	6	213298	213303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119440
3993	NC_003064	CAA	2	6	213376	213381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3994	NC_003064	ATCTAC	2	12	213395	213406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3995	NC_003064	GAT	2	6	213469	213474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3996	NC_003064	CG	3	6	213559	213564	0 %	0 %	50 %	50 %	17938801
3997	NC_003064	CACCT	2	10	213678	213687	20 %	20 %	0 %	60 %	17938801
3998	NC_003064	CGG	2	6	213696	213701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17938801
3999	NC_003064	TGC	2	6	213708	213713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17938801
4000	NC_003064	GTG	2	6	213762	213767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17938802

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